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ThruPLEX® DNA-Seq HV & ThruPLEX® DNA-Seq HV PLUS Kit
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech R400782 ThruPLEX® DNA-Seq HV PLUS Kit 24 Rxns 询价
Clontech R400783 ThruPLEX® DNA-Seq HV PLUS Kit 96 Rxns 询价
Clontech R400740 ThruPLEX® DNA-Seq HV 96 Rxns 询价
Clontech R400741 ThruPLEX® DNA-Seq HV 24 Rxns 询价
Clontech R400736 ThruPLEX® DNA-Seq HV Core Components 96 Rxns 询价
Clontech R400737 ThruPLEX® DNA-Seq HV Core Components 24 Rxns 询价
Clontech R400739 ThruPLEX® HV UDI 1-24 24 Rxns 询价
Clontech R400738 ThruPLEX® HV UDI Set A 96 Rxns 询价
 
高起始量通用型DNA-Seq分析
ThruPLEX® DNA-Seq HV & ThruPLEX® DNA-Seq HV PLUS Kit
· 兼容更高起始量的多种样本:5至200 ng FFPE DNA、cfDNA起始,30 μl建库体积,无需浓缩样本●!
· 删繁就简:单管三步操作流程,2 h内完成文库构建●!
· 一致高效可靠:无畏起始量差异,高实验重复性、更均一的文库覆盖度,高GC含量区域偏差更小●!
· 更适用于临床相关样本及肿瘤学研究等应用领域●!
· ThruPLEX® DNA-Seq HV PLUS Kit包含酶切片段步骤,提供完整文库构建流程!
 
ThruPLEX® DNA-Seq HV产品说明
出色的NGS文库构建系统必须具备“流线型”、简便的操作流程,兼容更大的DNA起始量范围,同时还必须保证结果的可靠性。Takara科学家特别优化、研制的ThruPLEX DNA-Seq HV文库构建系统,具有流程完整、快速,文库复杂度高、结果可靠性高、兼容困难样本等特点。采用单管操作流程,市面上鲜有比ThruPLEX DNA-Seq HV流程更快速、更连贯、适合更高样本通量的产品。此外,没有同类产品的流程中需要耗时的磁珠纯化步骤,ThruPLEX DNA-Seq HV单管操作的设计能大大减少珍贵样本的损耗●!使用时无需稀释接头,ThruPLEX DNA-Seq HV进一步减少了手动操作时间,删繁就简●!
 
ThruPLEX DNA-Seq HV支持5-200 ng DNA起始,起始体积提升至30 μl,样本无需浓缩●!通过这样的改进,ThruPLEX DNA-Seq HV所建文库能获得基因组覆盖度更高、突变检测更正确的测序数据。面对不同GC含量的样本,我们的系统都能产生覆盖度更均匀且一致的实验数据。
 
■ 流程简便,节约您的宝贵时间
(数据来源于Takara Bio USA, Inc.)
表1 Takara科学家分别采用5/200 ng DNA起始,比较了ThruPLEX DNA-Seq HV与其他品牌同类产品制备文库的操作流程,建库总时长为制备足量双端Illumina文库的时间。从上表可以看出,ThruPLEX DNA-Seq HV是唯一采用单管操作、无需接头稀释且过程中无需磁珠纯化的系统,建库总时长与手动操作时间均为最短,操作最为便捷●!
 
■ 不同GC含量,一致均匀覆盖
实现一致、均一的GC覆盖度并不容易,要求文库构建系统对不同GC含量的基因组都能提供正确、均一的覆盖。实验结果证明:无论是以gDNA还是以不同GC含量的实际样本起始,ThruPLEX DNA-Seq HV均能构建出GC覆盖度均一的文库●!
 
 
■ “妥协”的FFPE 样本,不“妥协”的DNA-Seq性能
若要长期保存临床研究组织样本,往往需要福尔马林进行固定处理,处理后即为福尔马林石蜡包埋样本(FFPE)。但福尔马林会造成样本中的核酸降解,表现为核酸品质差、含量不足,致使后续的高品质文库构建出现困难。ThruPLEX DNA-Seq HV采用优化的技术与流程,无惧FFPE样本的挑战●!
Takara科学家比较了ThruPLEX DNA-Seq HV与A公司的同类产品所建文库的测序数据,样本分别是50 ng与5 ng起始的formalin-compromised样本(模拟的FFPE样本)、30 ng与5 ng起始的FFPE样本,三次生物学重复。
 
图1 ThruPLEX DNA-Seq HV所建Formalin compromised文库具有更高的平均靶标覆盖度 两个试剂盒所建文库采用AMPure磁珠纯化、pool后用IDT xGEN Pan Cancer Panel (800kb human genome) 进行靶向富集,NextSeq 500/550 Mid Output Kit v2.5 (150 Cycles) 双端测序。每个文库downsample为5M reads,bowtie2软件将数据align至hg19。VarDict Variant Caller进行突变分析,最低覆盖度30X,最低等位基因突变频率0.5%。(数据来源于Takara Bio USA, Inc.)
 
图2 ThruPLEX DNA-Seq HV所建FFPE文库能检测到更多的突变 两个试剂盒所建文库的测序数据,三次重复中至少有两次检测到阳性突变被计算为有效阳性突变。(数据来源于Takara Bio USA, Inc.)
 
ThruPLEX DNA-Seq HV PLUS Kit产品说明
ThruPLEX DNA-Seq HV PLUS Kit是在ThruPLEX DNA-Seq HV的基础上,整合了ThruPLEX HV PLUS Enzymatic Fragmentation Module的完整文库构建试剂盒。ThruPLEX DNA-Seq HV PLUS Kit保留了ThruPLEX HV的显著功能,并且无需在文库制备之前进行任何机械打断或单独的酶切片段化处理,从而实现了性能和速度的充分结合●!
 
 
■ 更小的偏差,更真实再现样品的原始信息能
测序文库必须获得样品的完整序列信息来真实的反映样本情况。起始量越低,则越难获得覆盖均一的测序数据,如果建库DNA起始量越低,则均一覆盖模板的概率越低,使得文库构建变得更加困难。另外,在较低的起始量浓度下,文库重现性可能会受到影响。ThruPLEX DNA-Seq HV PLUS Kit在推荐起始量范围内,均具有非常好的重现性●!重要的是,在推荐的最低起始量5 ng的情况下,仍表现出色●!
 
 
■ 更加卓越的覆盖均一性,帮您还原真实的基因组信息
Takara科学家比较了ThruPLEX DNA-Seq HV PLUS Kit与A公司和B公司的同类产品所建文库的测序数据,样本分别是50 ng与5 ng起始的NA12878 gDNA,三次生物学重复。(数据来源于Takara Bio USA, Inc.)
 
图3 使用 NextSeq 500/550 Mid Output Kit v2.5 (150 Cycles) 双端测序。每个文库downsample为5M reads。蓝色柱形图显示100-bp windows的GC含量分布。与其他两种试剂盒相比,ThruPLEX DNA-Seq HV PLUS Kit生成的文库显示,覆盖率更接近理想的归一化覆盖率。
 
上表数据显示,相较于其他公司试剂盒,本试剂盒构建的文库重复率更低,均一性更好●! (数据来源于Takara Bio USA, Inc.)
 
 
 
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