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产品选择指南

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SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech R400750 SMART-Seq® Single Cell PLUS Kit 48 Rxns ¥47,828
Clontech R400751 SMART-Seq® Single Cell PLUS Kit 96 Rxns ¥85,494
Clontech R400744 Unique Dual Index Kit - 48U 48 Rxns 询价
Clontech R400745 Unique Dual Index Kit - 96U 96 Rxns 询价
Clontech 634470 SMART-Seq Single Cell Kit 12 Rxns ¥13,341
Clontech 634471 SMART-Seq Single Cell Kit 48 Rxns ¥37,759
Clontech 634472 SMART-Seq Single Cell Kit 96 Rxns ¥65,697
无标题文档
 
 
全长转录组分析 延伸     NGS文库制备 NGS文库定量
单细胞全长cDNA制备 NGS文库制备系统
         
单细胞RNA-Seq文库制备
 
 
SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell Plus Kit:更胜一筹的单细胞mRNA全长分析
· 简便,基于Plate的工作流程 - 可直接以FACS或其他方法分选的单细胞起始
· 单管操作流程 - SMART-Seq Single Cell PLUS Kit包含完整的cDNA合成和文库构建流程,分别在单管中进行,减少样品损失与混淆,降低手动操作误差
· 灵敏度高和一致性好 - 非常适用于单细胞(尤其是RNA含量非常低的细胞和细胞核)RNA-Seq的研究,可检测更多基因
· 可靠的全长cDNA分析 - 性能优于许多现有的单细胞全长cDNA合成方法,例如Smart-seq2
· 增强的测序性能 - SMART-Seq Single Cell PLUS Kit整合双端特殊index(UDI),即便多个文库pool后用高通量型Illumina测序仪(如Novaseq)分析,也能得到正确结果
· 高度灵活的工作流程 - 可与自动化设备兼容
· 更高的文库产量 - 更便于使用高通量型Illumina测序仪分析(如Novaseq),或保存剩余的文库用于多次测序
 
产品说明
SMART-Seq Single Cell Kit (SSsc) 和SMART-Seq Single Cell PLUS Kit (SSsc PLUS) 是Takara科学家专门研发推出的两款具有高灵敏度和高可再现性的试剂盒,适用于单细胞和单个细胞核的RNA-Seq分析。试剂盒采用oligo(dT)引物,可从一些RNA含量非常低的单细胞(如PBMC, T细胞,B细胞)直接起始,并完成全长cDNA的捕获。
 
SMART-Seq Single Cell Kit是基于经典的SMART技术优化改良而来的单细胞cDNA合成试剂盒,可以提供全长转录本的信息,支持分析转录本异构体、融合基因、点突变等广受科研人员关注的研究内容,具有更高的灵敏度和再现性。此外,该试剂盒还能提供均一的gene body覆盖度,高GC含量转录本也能得到正确分析。这些改进使得SSsc更适合单细胞分析,能得到更多有效reads、更高的基因检测数,对珍贵样本的理解更透彻●!这些特点使SSsc远远超过许多现有的单细胞全长cDNA合成方法,例如SMART-Seq2●!
 
SMART-Seq Single Cell PLUS Kit在包含核心的cDNA合成试剂基础上,同时整合了Takara Bio Group专利性的文库构建技术及单次使用的双端特殊index(UDI),提供完整的单细胞cDNA合成到文库构建的实验体验。建库试剂中包含片段化酶,以实现对合成cDNA的片段化,接着利用特别的茎环形接头构建高品质Illumina文库。在建库阶段,单管两步操作、过程中无需纯化、2 h即可建成文库●!
 
 
SSsc:更胜一筹的单细胞全长转录组分析●!
 
The SMART-Seq Single Cell Kit outperforms Smart-seq2
图1. 与Smart-seq2法的比较
 
Takara科学家以淋巴母细胞系GM12878单细胞为样本制备文库,分别采用SMART-Seq Single Cell Kit(SSsc,18个重复)和Smart-seq2法(Smart-seq2,20个重复)合成cDNA(均进行19个PCR循环扩增),所有样本都均一化至1.75M paired-end reads,然后制备RNA-Seq文库并进行测序分析。
 
Panel A 根据cDNA的制备方法不同,结果也不同。相比而言,Smart-seq2结果中比对到线粒体基因组的比率较高,而检测到基因鉴别的reads数相对较少。
Panel B SMART-Seq Single Cell Kit能检测到比Smart-seq2更多的基因。
 
SSsc PLUS Kit:不只是一个Kit,更是完整且更胜一筹的单细胞RNA-Seq建库体验●!
 
为了使单细胞cDNA合成、文库构建实验“一步”到位,我们全新推出了SSsc PLUS Kit,从此您无需再单独购买建库?椋膊挥“忍受”不同厂家不同步的供货周期。
 
 
 
从高灵敏度、高重复性的cDNA合成出发,构建更高品质Illumina文库
 
Takara科学家以10 pg小鼠脑total RNA起始,采用SMART-Seq Single Cell Kit完成cDNA合成。随后分别采用SSsc Plus Kit中的SMART-Seq Library Prep Kit?橛胧忻嫔辖铣S玫腁公司试剂盒构建文库,并比较性能差异。
 
 
从测试数据中可以看出,SSsc PLUS Kit所建文库的产量是A公司Kit产量的5倍,而更高的文库产量更适于高通量型Illumina测序仪,如Novaseq。
 
 
两种方法所建文库随后用Nextseq 500完成测序,并对TPM(Transcripts per million)≥0.1的基因数进行统计。相较于A公司文库,SSsc PLUS文库能检出更多的基因,从同样的cDNA起始能“捕获”更全的信息●!
 
 
比较数据来源于Takara Bio USA, Inc.
 
SSsc点击图片下载
 
 
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